Kaupunki tunnetaan parhaiten kristallinkirkkaista joistaan. Vedessä oleva mineraali sitoo mahdolliset epäpuhtaudet, jonka ansiosta ne painuvat heti pohjaan. Aquario Natural Baia Bonita on suositeltava retkikohde, jossa märkäpuvussa ja snorkkelinaamarissa voi kellua hitaassa virrassa useita kilometrejä. Tämän epätävällisen matkan aikana voi ihailla kaikkia veden alla eläviä kaloja ja muita eläimiä.

Lyhyestä välimatkasta huolimatta luonto on hyvin erilainen kuin Pantanalissa. Täällä on paljon luolamuodostelmia, joista tunnetuimmat ovat Gruta do Lago Azul, missä on sinisenä loistava maanalainen järvi, sekä Abismo de Anhumas, 72 metriä syvä kuilu, johon tarvitaan kiipeilyvarusteita. Kun pääsee pohjalle, palkintona ovat fantastiset stalakiittimuodostelmat sekä järvi, jossa voi snorklata tai sukeltaa. Boniton ympäristössä on myös useita luontopolkuja, jotka johtavat vuorten ja viidakon läpi vesiputousten ja luonnon muovaamien makean veden altaiden luo.

Bonitossa ja sen ympäristössä on valittavina paljon seikkailuaktiviteetteja: luolasukellusta, viidakkovaellusta ja koskenlaskua muun muassa. Alue on kuitenkin kärsinyt yhä kasvavista vierailijamääristä, ja vain luvan saaneet eko-oppaat saavat työskennellä alueella. Retkikohteiden osanottajamäärät on rajoitettu, ja useiden retkien osanottajamäärät ovat 20 henkeä tai enemmän. Bonitosta on tullut hyvin suosittu brasilialaisten turistien keskuudessa, ja jos haluaa välttää tilanahtautta tai varmistaa osallistumisen retkille, kannattaa välttää juhlapyhiä ja lomakausia joulukuun ja tammikuun välillä sekä heinäkuussa.

Bonito on ollut turistikohde vasta vähän aikaa, joten huvitusmahdollisuuksia ei ole monia. Taboa-baarista on kuitenkin tullut jonkinlainen instituutio. Sinne kerääntyvät turistit ja paikalliset oppaat iltaisin keskustelemaan ja vaihtamaan kokemuksia. Kannattaa pitää mielessä, että Boniton turismin parissa työskentelevät puhuvat yleensä vain portugalia ja että kuljetus ei yleensä kuulu paikan päällä ostettavien retkien hintaan. Varaa siksi Bonition retkesi jo kotona ennen lähtöä.